В 1527 году Маргарита вновь вышла замуж. На этот раз за короля Наварры — Генриха д’Альбре. Ее второй муж был далек от запросов и интересов Маргариты и прославился больше политическими интригами и многочисленными любовными авантюрами. Маргарита не нашла и в этом браке семейного счастья. Впрочем, теперь она стала матерью — в 1528 году у нее родилась дочь Жанна (будущая королева Наварры и мать французского короля Генриха IV Бурбона), а в 1530 году — сын Жан, не проживший и 6 месяцев.

Замужество Маргариты значительно отразилось на судьбе французской Реформации. Ее брак не позволял ей жить при дворе Франциска I и, стало быть, непосредственно влиять на политику брата. Могущественная заступница и покровительница гуманистов и протестантов, какой была Маргарита все это время, переселилась теперь в далекое пограничное королевство — Наварру. И вместе с ней из французского двора уходило Возрождение в его лучших формах. К 1527 году завершился тот период в жизни Маргариты, когда она была вторым человеком Франции, — период наибольшего влияния на Франциска.

Наступил «наваррский» и, может быть, самый плодотворный период ее жизни. Период отдаления от парижского двора, от «большой» политики ее брата, период погружения в дела ее крошечного королевства и в дела семейные, период размышлений, творческих исканий и подведения итогов.

Вновь овдовев в 1543 году, Маргарита стала полной правительницей Наваррского королевства, а ее двор превратился в центр культурной жизни Франции. В замках Нерака и По — резиденциях Маргариты забурлила небывалая дотоле умственная жизнь, для Наваррского королевства наступила эпоха Возрождения. Став королевой Наварры, Маргарита собрала при своем дворе в Нераке кружок гуманистов. С неракским замком этого времени связаны имена крупных французских поэтов, ученых, художников, реформаторов, которые, не найдя приюта в большом государстве Франциска I, нашли пристанище в маленьком королевстве его сестры.

Друзьями Маргариты были такие известные писатели-гуманисты, как Клеман Маро, Этьен Доле, Бонаван-тюр Деперье, Пьер де Ронсар и многие другие. Блестящий поэт Франции первой половины XVI века К. Маро был представлен Маргарите еще в 1519 году, с тех пор между ними установились дружеские отношения, сохранившиеся до 40-х годов. Б. Деперье в 1536 году стал ее личным секретарем. Вероятно, именно для придворного кружка гуманистов и литераторов он начал составлять свои новеллы «Новые забавы и веселые разговоры», написанные в традициях «Декамерона» Боккаччо и «Фа-цетий» Поджо. При дворе Маргариты этот крупный писатель и мыслитель эпохи Возрождения создал свое лучшее произведение «Кимвал мира». Другим секретарем Маргариты был переводчик «Декамерона» Антуан Ле Масон. Выполненный им в 1545 году новый перевод «Декамерона» он посвятил Маргарите.

К последнему, «наваррскому» периоду относится расцвет творческой деятельности Маргариты. Маргарита-литератор пробовала свои силы в различных жанрах, творческое наследие ее пестро и неравноценно по своим литературным достоинствам. Она писала стихи, аллегорические поэмы, пьесы; сохранилась ее переписка, прежде всего письма к брату Франциску, их более 150.

В 1547 году вышел сборник стихотворений Маргариты Наваррской «Маргаритки Маргариты из принцесс», в эти же годы королева Наварры работала над лучшим своим произведением — сборником новелл «Гептаме-рон». По своей внешней структуре «Гептамерон» повторял одну из любимых книг Маргариты «Декамерон» Боккаччо. Сборник остался незаконченным, в него вошли лишь 72 новеллы. Маргарита написала семь «дней» и начала восьмой. В связи с чем издатели дали этой книге такое произвольное название «Гептамерон», что означает «семидневник», «семиднев». Книга дважды издавалась в XVI столетии (1558, 1559) и существовала в 15 списках.

Говорят, Маргарита написала свою книгу забавляясь, между делом, в свободную минуту, предназначенную для отдыха от серьезных и важных занятий, — на носилках, путешествуя по стране. Долгое время «Гептамерон» считался одним из неприличнейших и непристойных сочинений. Но в том нет вины автора: Маргарита писала так, как говорили при дворе ее брата и в наваррском обществе. В то время иначе не умели и не могли писать. Значение этой живой и увлекательной книги, созданной в последние годы жизни королевы Наваррской, еще и в том, что это фактически первое прозаическое произведение на французском языке, который тогда только формировался.

«Гептамерон» появился в то время, когда французский гуманизм переживал последние мгновения своего расцвета; уходило поколение людей, чей талант позволил говорить о взлете французской культуры эпохи Возрождения. Франция находилась на пороге значительных политических потрясений, религиозных гугенотских гражданских войн, с началом которых французский гуманизм вступил в свой последний кризисный этап.

Маргарита Наваррская — королева, писатель, меценат, «добрый гений» французских гуманистов и протестантов — ушла вместе со своим поколением. В 1549 году ее не стало.

Две королевы