13 сентября 1309 года Климент V, побуждаемый королем к действию, объявил в консистории, в булле Redemptor noster, что он созовет в Авиньон всех желающих свидетельствовать, на 16 марта 1310 года, что дало (или потеряло, в зависимости от точки зрения) еще шесть месяцев. Вскоре после этого, 18 октября, он вызвал к себе обвинителей: короля Филиппа IV, его брата Людовика д'Эврё, Гийома де Плезиана и графа Жана де Дрё. Ногаре, центральная фигура, все еще отлученный от церкви, не был упомянут, но, тем не менее, именно он возглавил миссию в Авиньон, в то время как король послал своего представителя. Папа еще раз тщетно пытался добиться передачи всего дела себе, что фактически привело бы к его закрытию.

Поэтому судебный процесс открылся 16 марта 1310 года в доминиканском монастыре в Авиньоне, в то время как в Париже папская комиссия продолжала свои слушания по делу тамплиеров. Климент V председательствовал в суде либо лично, либо при посредничестве двух назначенных им кардиналов, которые были на стороне Филиппа IV: Этьена де Суизи и Беренгара Фредоля. Обвинителей, или oppositores, было пятеро: один священник, Ален де Ламбалль, секретарь короля и магистр с 1285 года, будущий епископ Сен-Брие, и четыре рыцаря: Гийом де Плезиан, Пьер де Галар, Пьер де Блано и Гийом де Ногаре. 20 марта Ногаре и Плезиан потребовали, чтобы старые и больные свидетели были выслушаны без промедления, пока они не умерли.

Все судебные акты,  обвинительные статьи и показания свидетелей были опубликованы в 1995 году в замечательном критическом издании Жана Косте: Boniface VIII en procès (Суд над Бонифацием VIII). Благодаря этому фундаментальному труду, ход заседаний суда прекрасно известен. Свидетели, тщательно отобранные Ногаре, в подавляющем большинстве выступили в пользу обвинения, и на них было оказано давление: в мае Климент V пригрозил отлучением тем, кто препятствовал свободе передвижения свидетелей и даче показаний.

На первой сессии, проходившей с 5 апреля по 17 мая, были заслушаны 24 свидетеля, в том числе 11 священнослужителей и 13 мирян. Их заявления в основном касались периода, предшествовавшего избранию Бенедетто Каэтани. Жан Косте подвел итог высказываниям, в которых его обвиняли. Говорят, что он сказал, что:

— Законы христиан и Мухаммеда имеют не божественное, а человеческое происхождение.

— Они имеют чисто сдерживающее значение: заставляют людей вести себя хорошо и жить в мире.

— Христианская вера, по-видимому, уступает другой, о чем свидетельствуют следующие моменты:

— Бог един в трех ипостасях — абсурд.

— Беременность и роды девственности — невозможны.

— Воплощение Сына Божьего — нелепость.

— Хлеб есть тело Христа — как можно в это поверить?

— Воскрешение мертвых — кто и когда-либо был свидетелем этого?

— Существование загробной жизни — кто когда-либо возвращался оттуда?

— Только фантазеры верят в чудеса.

— Господи, сделай мне самое худшее на том свете, до которого мне нет дела.

— Так я считаю и думаю, так думает и тот, кто не из vulgus (толпы).

Подозрительные и разоблачительные обвинения 

Список еретических изречений из уст Папы впечатляет, и его дополняют еще несколько высказываний в том же духе, например: душа человека умирает вместе с телом и ничем не отличается от души животных; никто не будет воскрешен; рай существует в этом мире только для богатых, а ад для бедных; если Христос не смог спасти себя, то как он может спасти других; грех плоти не более серьезен, чем потирание рук. Стоит отметить, что независимо от того, произносил ли Бонифаций VIII такие слова или нет, сам факт их произнесения доказывает, что в средние века, в начале XIV века, можно было рассматривать эти гипотезы, которые, взятые вместе, являются убеждениями современного атеиста или, по крайней мере, деиста, скептика или агностика. Это полностью опровергает утверждение о том, что, как утверждал Люсьен Фебвр, менталитет средневековья и Ренессанса исключал любую возможность неверия. Слова, приписываемые Бонифацию VIII, выражают именно те идеи, которые должен был перенять Вольтер.