Рассказывают, что ученик, оставшийся после святого Нила и бывший очевидцем скромности и глубокого смирения своего старца при земной его жизни, не вынося молвы от множества стекающихся мирян, тревоживших покой Святой Горы, будто бы решился жаловаться своему прославленному старцу на него самого, что он, вопреки своим словам — не искать и не иметь славы на земле, а желать ее только на небесах, — скоро весь мир наполнит славою своего имени и нарушит через то спокойствие Святой Горы, когда во множестве начнут стекаться к пещере для исцелений? Это так подействовало на святого мироточца, что тогда же миро иссякло. В недавнее время некоторые из кавсокаливских отцов, получившие исцеление от различных болезней через благоговейное молитвенное призывание святого, по чувству глубокой благодарности решились построить при его пещере храм. 7 мая 1815 года от Р. Х. было приступлено к постройке. Копая место для оснований храма, открыли незамечаемый дотоле свод, из которого вдруг вышло неизреченное благоухание. Надобно сказать, что до того времени все были уверены, что гроб преподобного и мощи его находятся при его пещере, но никто не знал определенно, в каком именно месте. Для непытливой веры достаточно было только знать, что там находится чтимая ею святыня. Итак, разломав этот свод, нашли под ним безценное сокровище — священные мощи святого, благоухавшие неизъяснимым райским ароматом. Тотчас же сообщили об этом лавре. Лавра немедленно послала туда иереев. Иереи, взяв с величайшим благоговением из-под свода святые мощи, перенесли их в лавру, где в то время находился Константинопольский патриарх блаженный Григорий V, который и участвовал при встрече святых мощей.
Лавра, прилично украсив череп и челюсть святой главы, первый оставила у себя, положив его во святом алтаре вместе с другими святыми мощами, челюсть же отослала в келлию святого Нила, во освящение пребывающих там и приходящих туда, ради благоговения к святому и почитания его памяти.
Между тем, окончен был устройством и священный храм при пещере святого Нила. Он, сообразно с пространством места, может вместить не более 10 или 15 человек. Позади алтаря сего храма означено место, где был гроб святого.
Следы потока мира и теперь заметны в скале (особая ложбинка).
Память преподобного празднуется 7 мая в честь перенесения его мощей и 12 ноября в день кончины.
Монашествовав Богоугодно в Горе Афонстей, в молитвах и постах Бога взыскал еси. И стал еси приятелище чистое Духа, облиставая верным добродетелей лучи, ими же осияваеши, Ниле, вопиющих тебе: Слава прославльшему тя Богу, слава венчавшему тя, слава действующему тобою всем исцеления.
Еже от земли явление священных мощей твоих, Ниле, совозсияло сиянию[179]
Креста, того бо вожделел еси тепле от младенства. Кости твоя, сораспявшияся Христови, воскресшему, яко превечному Богу, того прияша благодать.